Egy állandó bázis épül a Hold déli sarkánál található Shackleton-kráterben. Te vezeted az egyik űrügynökséget, amelyek együttműködnek a bázison való jelenlétük bővítésén, miközben a küldetést támogató három nagyvállalat mindegyike a saját terveit követi. A Shackleton Base: A Journey to the Moon játékban építményeket fogsz építeni a bázison, miközben a vállalatok projektjeit is finanszírozod, amelyek különleges képességeket és pontozási lehetőségeket biztosítanak.

A játék elején válassz véletlenszerűen három vállalatot a hét elérhető közül. Minden vállalat új projekteket, akciókat és pontozási lehetőségeket mutat be, valamint azok konkrét mechanizmusait. A játék három fordulóból áll, amelyek mindegyike három fázisra oszlik:

• Űrhajó fázis: Minden játékos egy űrhajólapkát húz egy nyitott kínálatból, hogy meghatározza, milyen típusú űrhajósokat és erőforrásokat használhat az adott fordulóban, valamint a következő fázis sorrendjét.
• Akció fázis: A játékosok felváltva telepítik űrhajósaikat a Holdra, hogy erőforrásokat gyűjtsenek, építményeket építsenek vagy projekteket finanszírozzanak. Attól függően, hogy mely vállalatokat választották ki, különböző típusú erőforrások lesznek elérhetők, amelyeket különféle módon lehet felhasználni projektekhez vagy építmények építéséhez. Minden projekt folyamatos képességeket és pontozási lehetőségeket biztosít. Minden vállalat különböző módokat kínál a pontok megszerzésére, amelyek lehetnek az akciófázisban, a karbantartási fázisban vagy a játék végén.
• Karbantartási fázis: A kiküldött űrhajósokat az építményeken való munkára osztják be (bónuszt biztosítva a tulajdonosuknak), majd a játékosok bevételt gyűjtenek és karbantartási költségeket fizetnek. Ha a játékban lévő vállalatoknak körvégi hatásaik vannak, ezek a hatások érvényesülnek.

A játék végén kerül sor a végső pontozásra, ekkor a legtöbb ponttal rendelkező játékos nyer.